清流成土母岩主要是震旦系酸性岩，中生界沉积岩，根据清流县林业用地土壤普查，按照《福建省第二次土壤普查工作分类暂行方案》的分类标准，全县林业土壤分为5个土类，10个亚类，23个土属。

　　红壤 分布在海拔250——1000米的丘陵山地，总面积为221.59万亩，占全县林业用地的94.6%，是清流地带性土壤亚类，在本土类的五个亚类中，以红壤面积为最大，达166.09万亩，占本土类的70.89%，广泛分布于800米以下的低山丘陵的山坡，山顶或整个山体，PH值在3.5——5.1之间，有机质含量0.5——6.44%。可分为4个土属：酸性岩红壤70.26万亩，占42.3%，泥质岩红壤36.33万亩，占21.87%，砂质岩红壤55.99万亩，占33.71%，石灰岩红壤3.52万亩，占2.12%。

　　黄红壤 面积16.21万亩，占6.9%，主要分布在长校、沙芜、灵地等乡的部分地区，本亚类有3个土属：泥质岩黄红壤面积41602亩，占25.67%，酸性岩黄红壤72345亩，占44.64%，沙质岩黄红壤48111亩，占29.68%。

　　暗红壤 面积16984亩，占0.76%，主要分布在余朋、温郊、洞口、大横溪等乡村茂密的阔叶林下，山坡中下部的水沟边。本亚类土属有泥质岩暗红面积1988亩，占11.71%，沙质岩暗红壤面积14996亩，占88.29%。

　　水化红壤 面积22988亩，占0.98%，分布于海拔300~500米山坡下部，溪流岸边或谷地，呈零星小块关分布。本亚类土属有：酸性岩水化红壤1361亩，占5.92%，泥质岩水化红壤16530亩，占71.91%；沙质岩水化红壤5097亩，占22.17%。

　　粗骨性红壤 面积35.29万亩，占15.06%，分布于500~800米的山坡上部。本亚类土属有本性岩粗骨质红壤12.17万亩，占34.49%；泥质岩粗骨性红壤8.25万亩，占23.38%；沙质岩粗骨性红壤14.78万亩，占41.87%；石灰岩粗骨质红壤870亩，占0.25%。

　　黄壤 面积18429亩，占0.78%，分布在海拔800~1500米的中山地带的大丰山和里田乡的鳌峰山。本亚类有2个土属：泥质岩黄壤面积6536亩，占35.46%；沙质岩黄壤面积11893亩，占64.53%。

　　粗骨性黄壤 面积986亩，占0.04%，分布在大丰山和里田乡鳌峰山等海拔1000——1500米的山峰，只有一个土属酸性岩粗骨性黄壤。

　　草甸土 面积1781亩，分布在大丰山主峰海拔1600米以上地带，只有一个土属砂质岩山地草甸土。

　　石灰性土 面积2020亩，分布在林畲乡石下村，只有一个土属黑色石灰柱土。

　　酸性紫色土 面积10.38万亩，分布在嵩溪、东华、里田乡海拔300~800米的丘陵地带。有2个土属：泥质岩酸性紫色土30497亩，占29.39%；砂质岩酸性紫色土73256亩，占70.61%。