宋代置县后，清流始“授田定税”。税务由主簿兼办。明、清税务由县直接征收。

　　民国2年起，税收由财政科分管。民国26年，成立清流县经征处，设主任、股长、会计、事务员。民国35年，改称清流县税捐征收处。民国36年1月，福建区货物税局设宁清办事处，次年1月，改设清流驻征处。民国37年8月，清流属龙岩国税征稽管辖，设宁清办事处清流驻征处，直至解放。

　　1950年2月，清流县税务征收由县人民政府财粮科分管。7月，成立清流中心税务所，全县分设嵩溪、灵地、沙芜税务所。1955年8月，改设税务局。1958年8月，并入财政局设税务股。1969年8月，设财税管理站，归属县革命委员会生产指挥组。1970年12月，改称县革委会财政局。1979年5月，恢复税务局，1990年，实有职工99人。