元明时，清流实行世袭兵役制。明嘉靖二十一年(1542)，有军户316户，铺兵6户，校尉力士1户，在永得里设屯田一所，在林畲冈建粮仓收贮军粮。自明万历后，许多军户弃田逃散，县内的世袭兵役制逐渐消失。此后，实行招募役。清代基本沿袭明后期的募兵制，惟法则稍有不同。顺治初年，兵役分常备、后备两种。咸丰年间，太平天国农民起义，县内招募义勇110人操习为后备，以应非常。