清流县有佛教、道教、基督教。佛教传入最早，唐武德三年(620)，僧云谷到县创建金莲寺。道教在宋淳熙年间由刘道士、欧阳真人在大丰山修道，其后逐渐发展。清光绪末年，基督教由长汀传入。天主教于民国37年(1948)由宁化天主公署传入县境。

　　清流县主要盛行佛教，其次是基督教。宗教活动兴衰不定。宋、清时期，县内佛教最为盛行，寺庙庵堂遍布全县各乡村。民国时期宗教活动仍很活跃。

　　解放初，佛教、道教、基督教继续活动。“文化大革命”期间许多寺观、教堂被拆被占，神职人员被迫还俗，宗教活动停止。中共十一届三中全会后，宗教信仰自由政策得到贯彻落实。

　　唐武德三年，僧尼云谷到清流创建金莲寺。唐贞观年间，沙芜铁石创建灵山寺。宋代清流置县后，佛教达到极盛。在城区东华山兴建清福寺和万寿寺、福寿寺。至元代，元世祖设宣政院，专掌释教僧徒，独尊西藏喇嘛教，佛教发展受阻滞。清康熙、乾隆间推崇佛教，清流佛教寺庙有一半兴建于是时。清中叶后，寺庙多半毁坏，教徒渐减。至清末，主要寺庙有金莲寺、长校贵人寺。民国22年(1933)2月19日，中国佛教分会在清流金莲寺改选，会员69人，出席会议47人。民国26年，全县寺庙14座，教徒48人。民国33年1月16日，成立清流佛教分会，会员64人，监事3人，理事9人。民国37年2月21日，召开中国佛教分会福建省清流县支会，改选第三届理监事大会，出席会议58人，　会议选出理事9人。

　　1950年，全县有佛教寺庙庵堂40多座，教徒100余人。1965年，有寺庙24座，和尚32人，尼姑68人，居士4人，分布在7个公社21个大队。“文化大革命”中，佛教活动均告停止。全县有清福寺、香山寺、万寿寺、灵山寺、仙人峰、醉峰寺、清水寺、福善寺、福潭寺、新福寺等10座寺庙被毁。

　　1980年始，宗教信仰自由政策得到贯彻落实。各乡热心民众出资出力，修建“文化大革命”期间被毁坏的寺庙，原有僧尼逐步返回，佛事活动恢复。1982年开放金莲寺。1985年4月1日、1987年7月11日、1990年9月3日相继在金莲寺召开第一、二、三届县佛教代表会议。

　　1990年，全县有大小寺庙30座，即：长校乡的贵人寺、云峰寺、醉峰寺、福源寺、龟湖寺、龙门庵、白云寺；里田乡兴善寺、福善寺、崇桢寺、清永寺；李家乡的隐山寺、金山寺；灵地乡的天星寺；邓家乡的香山寺、苳山寺；赖坊乡的灵山寺、竹林寺；田源乡的新山寺、新福寺、东林寺；嵩口镇的福胜寺、荫山寺、龙峰寺、华灵寺；嵩溪镇的竹云寺、清源寺；沙芜乡的灵山寺；温郊的上阳山；龙津镇的金莲寺。寺庙有常住人员114人，其中比丘僧24人，比丘尼29人，沙弥僧5人，沙弥尼、优婆塞、优婆姨各1人，男居士19人，女居士34人。

　　清流县僧尼的课诵活动以金莲寺、醉峰寺、贵人寺、福胜寺、兴善寺、香山寺等6个寺庙较为正常。主要有朝暮二时课诵、诞辰课诵、荐亡课诵等。

　　佛教根据“自治、自传、自养”的三自方针，走“农禅并举”之路。金莲寺、贵人寺、醉峰寺、兴善寺、龟湖寺、崇祯寺、竹云寺、东林寺等处僧、尼不但做好佛事，还种植水稻、蔬菜、茶叶、毛竹、油茶、柑桔、桃、李、棕、杉等作物，以劳动养寺。1984、1989、1990年金莲寺连续被省佛教协会和市宗教局、市佛教协会评为“农禅并举”先进单位。

　　主要寺庙

　　金莲寺　是清流古八景之一。位于城郊东部。唐武德三年(620)僧云谷游览曹溪，隐居此山。据传开初缺水，圣僧定光一日云游至此，飞锡凌空，七日复还，再用竹筒引水，始有清泉喷涌。定光为其命名“灞涌岩”。该寺主要供奉“定光古佛”。宋绍兴六年(1136)重修殿宇，元至正四年(1344)又进行翻修。明洪武二十四年(1391)创建佛庐。明万历三十二年(1604)，吏部尚书裴应章重修金莲寺时曾题楹联“泉声夜夜三春雨，山气时时五色云”镌于寺门。清嘉庆间，上、中殿被大火焚毁，旋即修复。民国32年(1943)，住持释古济修复钟鼓楼。1953年，金莲寺失火，仅余古佛殿，1969年，古佛殿被拆。

　　1980年始，由善男信女捐资出力重建“观音阁”、“三宝殿”、“古佛殿”和宿舍、膳厅、灵照塔等，建筑面积达636平方米。1982年，该寺对外开放。1990年有僧尼25人，其中比丘僧5人，比丘尼13人，居士7人。当年收入1.2万元，寺产有稻田8.25亩，茶果4亩，竹山2亩，茶山2亩。

　　贵人寺　位于长校乡江坊村后屏贵人峰下，距县城55公里，系元代中期江坊族众所建。明代曾四度重修、扩建。明崇祯十七年(1644)，为兵乱所毁。清顺治十三年(1656)，住持正融率徒重建。康熙二十七年(1688)部分遭焚。康熙三十二年再次修建。康熙五十一年，重塑佛像。乾隆十七年(1752)、道光二十年(1840)、同治十年(1871)、光绪三年(1877)、民国10年(1921)，先后6次重修，使之渐具规模。“文化大革命”期间，僧尼被赶出寺庙。1978年，僧尼重返。1981年起，各方信士大力资助，改建大殿和楼房，新建一座宝塔，以劳动养寺，实现自养自给。1990年，常住人员10人，比丘僧4人，比丘尼3人，居士3人。寺产有山林12亩，稻田7亩，竹山3亩，种植杉木3000株、棕20株、桃250株等。

　　醉峰寺　明正德年间创建，地处长校乡河排村东灵台山。“文化大革命”期间被毁，佛像经典遭焚，僧尼下山。1983年，河排、沙坪、长校等村民众出资出力，按原样重建。1989年增设大雄宝殿、骨灰塔，建筑面积950平方米。1990年，常住人员11人，比丘僧2人，比丘尼3人，居士6人。寺产有山林10亩，稻田5亩，茶山5亩，竹山2亩。

　　兴善寺　位于里田乡洋庄阳坊河畔。明万历十五年(1587)首建。清康熙间，被洪水冲毁，后由该寺僧人重建。民国间由释盛礼、释盛贵扩建殿宇。“文化大革命”期间，归阳坊大队改作他用，僧尼返俗。1982年，僧尼返归修复，建筑面积达520平方米，寺僧实行“农禅并举”，人均产粮500公斤，产油20余市斤。1990年，有寺僧10人，5男5女。比丘僧3人，比丘尼4人，居士3人。寺产有稻田9亩，竹山3亩，茶山5亩。

　　仁寿寺　又称“仁寿峰”；在县东距城39公里的林畲乡舒曹村附近，有“独占鳌头”之称。该寺原是邱氏宗祠，明成化间，邱氏祖祠迁出，于此兴建崇祀神农氏的“五谷真仙庙”。1966年，庙宇、佛像被毁，僧尼返俗。1981年，落实宗教政策，僧尼返寺，重建殿宇，安装自来水，铺设水泥台阶。1990年前，该寺由邱氏“筹建会”经营。有比丘僧2人，居士2人，全年收入约4000元，主要靠信士、香客捐赠。

　　香山寺　位于邓家乡坑甲村与灵地乡青甲村之间，始建于唐末，历代屡废屡兴。解放初期有僧尼4人，水田9.8亩，山地30亩，池塘2口。1972年，被全部拆毁。1982年邓家、灵地乡民集资重建，建筑面积720平方米。主要信奉“三宝如来”和“十八罗汉”。常住寺僧8人，3男5女。

　　福胜寺　在嵩口镇□埔村，1950年前，该村有“福胜寺”、“观音堂”、“三官堂”等三座寺庵，“文化大革命”期间被毁。1984年于□埔桥头“天星窟”重建福胜寺，而“观音堂”、“三官堂”则分立左右，占地1350平方米。房屋建筑面积850平方米。常住寺僧9人，4男5女，香火旺盛，年均收入2万元。