明清时期，由知县直接掌握财政，按朝廷旨令征收的“皇粮国税”，除留下本县官吏、衙门工役薪俸及政务费用外，其余皆解缴朝廷。清流为省财政报帐单位，无管理权限。

　　民国初，经费来源主要是省财政补助、地方附加及杂项税捐。民国15年(1926)，国民党军队入闽，地方军阀纷起，税务机构由军队把持，巧立名目，任意征收。民国24年，国民政府公布《财政收支系统法》，明确规定中央、省、县三级财政体制。民国30年，全国财政划分为国家财政与地方自治财政，实行中央、县二级财政，划分国家税、地方税收支系统、地方各项杂派筹捐附加。民国35年，恢复中央、省、县三级财政，直至民国38年。

　　1950年2月，县人民政府设置财政科，实行“集中领导、统一管理、统收统支”的管理体制，国家修订税制，试行货物税、工商业税。1953年，实行中央、省、县三级体制，清流始为一级财政。

　　1954年，实行划税分成、固定比例、支出包干的办法，差额部分由省拨款补助。1956～1957年，扩大县级财政权限，县属行政事业单位，乡镇财政收入建立预算制度。1958年，根据国务院《关于改进财政体制的决定》，实行“核定基数，划分收入，收入总额相抵，多余上缴，不足拨补，一定三年不变，扩大地方机动财力”的办法，下放乡级财政，这一体制与国民经济建设计划脱节，仅执行一年。当年实行合并税种、简化纳税办法，调整税率，试行工商统一税。1961年，中央决定财政集中统一，继续推行“总额分成，一年一定”的办法，将拨归县的商业企业收归省，恢复专项拨款制度。1962年起，划出“小固定部分收入”部分的5种地方税，划给县固定收入，下放财政收支管理权限。1967年，取消“小固定收入”。1968年起，实行“收支两条线”的管理办法，即财政收入全部上缴中央，财政支出由省分配下拨。1972年，实行“定收定支、总额分成、差额补助、结余留用”的体制，国营商业、林业企业再次划给县管理，清流总额分成100%，超收分成比例为80%。1976年，实行“定收定支、收支挂钩、总额分成、一年一定”，核定清流县总额分成为100%，超额分成比例为60%。1980年，实行“增收分成，收支挂钩”，即以1979年实际收入为基数，当年收入比上年增收部分，县分成60%。1981年，为促使企业增收节支，财政支出实行县长“一支笔”的审批制度。

　　1982年，实行“划分收支，核定基数，递增缴补、分级包干，一定三年不变”的体制，又称“分灶吃饭”，由原来“条条为主”改为“块块为主”和“条块紧密结合”。1983年，为增加县财政收入，再次下放企业，把供销、商业三级批发站和零售企业的收入划归县财政预算收入，实施第一步利改税。1984年10月1日，实行第二步利改税，经过税利改革，有23种税。1985年，实行“划分收支、定额缴补、增收分成、分级包干”的新办法，核定清流县收入包干基数493.90万元，支出675.78万元，定额补助181.83万元。1988～1990年，实行“划分收支，核定基数，定额缴补，增收多留，分类包干，自求平衡”，核定收入包干基数1064万元。支出995.90万元，上缴定额68.10万元。收入比核定的收入基数增长部分实行固定比例分成办法，市核定清流分成80%，市分成20%，1990年，清流财政收入1379万元。