明清时期的儒学、书院、私塾没有规定学制。清光绪三十二年(1906)，规定初等小学堂　，学制5年，高等小学堂学制4年。宣统元年(1909)，初小学制为4年，高小学制改为2年，实行一学年两个学期制度，采用“百分制”记分法。民国3年(1914)，以秋季为学年之始。民国11年，小学改“四三制”为“四二制”(初小4年，高小2年)。民国25年，创办短期小学(学制1年)、简易小学(学制3年)，清流初级中学(学制3年)。

　　解放初，小学沿袭“四二制”，中学沿袭“三三制”，均在春秋两季招生。1951年，政务院颁布《关于改革旧学制的决定》，废除旧学制，规定小学实行“五年一贯制”。次年秋，灵地、城关小学实行五年制。1952年，中学为秋季招生始业。1953年仍采用“四二制”，中学学制不变。是年小学一律改春季招生始业为秋季招生始业。

　　1969年，小学实行“五年一贯制”，中学实行“二二制”(初中二年、高中二年)，改秋季招生为春季招生。1973年，中小学又改春季招生为秋季招生。

　　1978年，中学学制改为“三二制”(初中3年，高中2年)，统一在秋季招生。1982年高中恢复3年制，此后，全县中学统一实行“三三制”。1985年秋，实验小学及各中心小学招收第1期六年制新生，以后连续招六年制新生两届，1988年，根据清流县师资和教学设备等条件，全县小学学制改为五年制，招收七周岁儿童入学。