一、县医院

　　民国27年(1938)，省政府拨款1.1.87万元兴建清流卫生院，院址在城关三民路“惜阴学舍”旧址(今粮食局附近)，院长余瑞元。有工作人员9人，其中院长、医师、稽查员、护士、助产士、药剂员、会计员、事务员、雇员各1人。同时，在嵩溪设立分院诊所，有工作人员2人。民国30年，县卫生院有西医师3人、护士5人、助产士1人、中医5人。由于时局动荡，至解放前夕，县卫生院仅剩3人。

　　解放初，县人民政府接管卫生院，改称县人民政府卫生院。1954年，分设门诊与住院部，门诊设内科、外科和妇儿科；住院部为综合病区，实行12小时值班制；医技科室只设检验室，全院有工作人员26人。1956年增设中药房。1957年2月定名为县医院，有工作人员28人。1958年建立X光室。清流、宁化两县合并期间，县医院改称清宁县第二医院。1967年更名为县工农兵医院，有工作人员72人，其中卫生技术人员57人。1969年3月，县防疫站并入，组成人民卫生防治院，有工作人员134人。同年12月，福州协和医院104人下放清流，其中有省内外知名专家李温仁、李国芳、胡锡衷等，同时还带来供100张床位使用的医疗器械设备。当时防治院迁往坪背，有工作人员238人。1971年底，防治院分出防疫机构和人员，改称县中心医院，有工作人员157人，1976年，又改为县医院，有工作人员137人。此后，福州协和医院下放人员陆续抽调回福州。1979年，县医院有工作人员115人，其中技术人员85人。1990年，县医院门诊部设内科、外科、妇产科、儿科、药剂科、中医科、口腔科、五官科、放射科、检查科，有病床120张，工作人员168人，其中卫生技术人员124人。医院占地面积3.5万平方米，建筑面积11780平方米。

　　二、防疫站

　　1953年，县卫生院设防疫股，有专职工作人员1名。1957年8月，成立县防疫站，有工作人员5名。1963年，县防疫站设卫生、防疫、妇幼、宣传、检验和办公室等6个科室，有工作人员21人，其中卫生技术人员17人。“文化大革命”期间，卫生防疫事业受影响，防疫力量削弱，1969年，与县医院合并，设防治组。1971年防疫站与县医院分设，有工作人员14人，其中卫生技术人员11人。1982年，防疫站设立“冷链”办公室，有专职人员2名，防疫能力得到加强。1990年，县防疫站设防疫、地慢、食品、卫生、检验、宣传、行政等科室，有工作人员36人，其中卫生技术人员31人。占地2500平方米，建筑面积31218平方米。

　　三、爱国卫生运动委员会

　　1952年，在原防疫委员会的基础上成立爱国卫生委员会(简称爱委会)。初有环境卫生员1人。1958年初，爱委会下设办公室，主任、办事员均由卫生科人员兼职。1984年5月，爱委会、卫生科合署办公。1984年2月，与精神文明建设委员会合署办公。1990年，有工作人员2人。

　　四、妇幼保健所

　　1953年6月，在嵩溪建立妇幼保健站，有工作人员2人。1955年2月，并入嵩溪中心保健站。1956年县防疫站设妇幼组，有工作人员1人。1984年10月，成立妇女保健所，有人员14人。1990年，妇幼保健所设儿保、妇保两个科室，有工作人员7人，其中儿保医师1人，妇幼保健医师4人，妇幼保健医士、助产士各1人。

　　五、医药公司

　　1954年10月，县供销社经营中西药，设立国药批发门市部。1957年，成立县药材公司，下设1个门市部和1个批发部，县供销社经营的中西药品全部移交给该公司。1958年8月，县药材公司更名为县医药公司。1984年，城关增设两个零售门市部。1989年，县医药公司被省政府授予先进企业称号。1990年，有医药工作人员39人，其中主管药师2人，药师2人，药士13人。

　　六、中医院　

　　1989年11月，在城关卫生院设县中医院，一套人马两块牌子。